自然资源资产审计是对地方政府及相关部门的自然资源管理活动负责人以及与自然资源相关的企业负责人的责任履行情况和实施效果进行的审计，主要对领导干部任职辖区内土地、矿产、森林、水资源等保护、开发、利用、经营、管理以及生态环境保护情况进行审查，重点从以下四方面开展：

　　一是摸清家底，掌握基数。通过审查摸清领导干部任期内所辖区域土地、矿产、水、森林等资源分布情况，掌握数量、质量、价值等基础数据，分析变化，评价相关责任的履行情况。

　　二是审查自然资源资产和环境保护相关政策法规执行情况。如在矿产资源审计方面，调查了解执行矿产资源规划和相关政策执行情况，检查资源配置项目与国家矿产资源工业发展规划是否相符；检查所承担的探矿权、采矿权整合重组工作完成情况及其是否存在违反资源整合协议书，未整合或虚假整合的行为等。

　　三是审查自然资源资产开发利用情况。如对土地资源资产审计，检查土地审批、出让情况；抽查改扩建用地是否合法合规，是否符合土地利用总体规划和国家宏观调控政策，是否存在违反规划计划未批先用、先建后批、超审批范围建设现象等。

　　四是审查涉及土地、矿产等自然资源相关资金和环保资金的征收、管理、使用情况。如土地使用税、耕地占用税、土地出让金等税费、专项资金征缴和管理情况；审查资金使用情况，是否做到专款专用，有无截留、挤占、挪用和损失浪费现象和无预算开支、用专项资金平衡预算等问题；评价资金使用的绩效，是否达到保护环境、改善环境的目标。